miRNA和lncRNA相关SNPs数据库及其在肿瘤研究中的应用

摘要

微小RNA（microRNA,miRNA）是基因表达的关键调节因子。而长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）作为内源竞争RNA（competing endogenous RNA,ceRNA）,与mRNA竞争结合miRNA。miRNA靶标种子区域或者lncRNA上与miRNA结合区域的单核苷酸多态（single nucleotide polymorphism,SNP）的存在,可能影响miRNA与mRNA以及lncRNA与miRNA的结合,从而影响靶基因的表达水平和肿瘤的形成。随着lncRNA和miRNA相关SNPs被不断发现,后续的功能分析及其与人类疾病的关系等研究内容不断进展,对大量数据进行整合和分析并对相关SNPs进行分类就显得尤为重要,由此诞生了众多的SNPs数据库。本文将从基本注释信息内容,相关功能分析和简单应用等方面回顾常用的lncRNA和miRNA相关的SNPs数据库,为研究人员提供参考。