并发颌面间隙感染和并发糖尿病的龋病患者微生物群落多样性研究

摘要

目的通过16S rRNA高通量测序研究并发有颌面间隙感染及糖尿病的龋病患者体液中的微生物群落结构及其差异。方法收集兰州大学第二医院口腔科5例龋病患者病史资料,2例患者伴发颌面部间隙感染,3例患者伴有糖尿病。根据世界卫生组织的判断标准(WHO,1997年),所有患者龋失补指数(decayed,missing&filled teeth index,DMFT)≥4;采集2例颌面间隙感染患者脓液(X组)及3例糖尿病患者静脉血(Z组)各1.5 mL;提取上述两种体液细菌总DNA;PCR扩增16S rRNA V4区并利用Illumina Miseq测序平台进行双端测序;利用Mothur、MEGAN4及Cluster 3.0等软件进行细菌群落结构及多样性的差异分析。结果(1)5个样本共得到89891条平均读长为225 bp的优质序列,发现4491个OTUs(operational taxonomic unit,OTU),2795个物种,归属12个门,82个属;(2)PCoA(principal co-ordinates analysis)分析表明两组微生物群落结构差异较大;(3)541个OTUs同时出现在两组样品中,这些共有OTUs在门水平属于厚壁菌门和变形菌门,在属水平上是链球菌属、志贺菌属、韦荣氏球菌属、孪生球菌属、消化链球菌属、口臭致病菌和埃希氏杆菌属。结论龋病伴发颌面间隙感染组和伴发糖尿病组体液微生物群落结构有较显著的差异,但该两种体液内存在多种共有的菌属,这些共有菌属部分与龋病直接相关,如链球菌属等,部分与龋病的关系不明确,如志贺菌属、埃希氏杆菌属等。这些共有菌属在龋病、颌面间隙感染及糖尿病中的作用,值得进一步深入研究。