β-内酰胺酶耐药基因bla_(OKP)进化及其侧翼序列特征研究

摘要

为研究β-内酰胺酶耐药基因bla_(OKP)进化及其侧翼序列情况,本文通过全基因组测序技术对肺炎克雷伯氏菌进行测定,分析了其中bla_(OKP)基因及其侧翼序列的特征,同时与不同亚型的bla_(SHV)侧翼序列进行了对比。研究发现,bla_(OKP)、bla_(SHV)基因进化差异明显,分为两个进化支,其中bla_(OKP)分为两个进化亚组(bla_(OKP-A)和bla_(OKP-B))。侧翼序列分析结果表明,bla_(OKP)基因的侧翼序列中无可移动遗传元件,与染色体介导的基因bla_(SHV)的侧翼序列结构相似,但存在差异,主要表现为bla_(OKP)基因的一侧与Kdp C相连,bla_(SHV)基因的一侧与RecF相连并具有ygbN-ygbM-ygbK结构。同时由质粒介导的bla_(SHV)基因的两侧存在多种可移动遗传元件。这些结构差异可能是导致bla_(OKP)耐药基因进化缓慢的原因之一。本研究通过对bla_(OKP)基因及其侧翼序列特征进行研究,研究发现bla_(OKP)基因及其侧翼序列结构保守是其相对bla_(SHV)基因进化速度缓慢的重要原因。