蛋白质二级结构定义服务器DSSP和STRIDE的比较与应用

摘要

为了便于快速了解蛋白质的结构特征,解析已经通过X-射线衍射或者由核磁共振测定的蛋白质的二级结构,一些定义蛋白质二级结构的系统被建立起来。蛋白质二级结构定义软件DSSP和STRIDE都是旨在说明这些已测定的蛋白质原子坐标的软件,它们根据原子坐标将蛋白质残基划分为不同的二级结构,对于了解蛋白质的空间结构做了很大的贡献。本文对两者进行了深入的比较和分析,总结出DSSP和STRIDE的应用条件及各自的利弊得失。