葡萄全基因组WRKY转录因子鉴定和分析

摘要

为鉴定和分析葡萄全基因组中WRKY家族转录因子基因,利用生物信息学的方法,分析葡萄全基因组WRKY转录因子类型 、进化分析 、染色体定位 、基因结构 、保守元件和基因表达模式.结果表明:葡萄全基因组中有56个WRKY转录因子.序列比对和系谱进化表明,分为 Ⅰ 、Ⅱ 和 Ⅲ 三个组,Ⅱ 组分为 Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和 Ⅱ-e五个亚组.染色体定位表明,存在串联复制和分布不均现象,但是在3号染色体上无该家族基因定位.结构域和保守元件分析都说明葡萄WRKY(VvWRKY)家族的WRKY结构域是高度保守的.葡萄叶片中基因表达模式分析表明,VvWRKY家族的部分基因参与非生物胁迫.