乳腺癌中靶向抑制REST协阻抑制因子3表达的微小RNA的预测及其高通量数据验证

摘要

目的预测并采用高通量数据验证乳腺癌中靶向抑制REST协阻抑制因子3(RCOR3)基因表达的微小RNA(miRNA)。方法分别利用RNA22、miRanda、PicTar、TargetScan和PITA 5种不同软件预测靶向抑制RCOR3基因表达的miRNA,然后取其交集。通过高通量数据验证所获miRNA对RCOR3表达的负向调控作用,并经泛癌症分析进一步验证miRNA对RCOR3表达的抑制作用。结果取交集后得到miRNA-128-3p、miRNA-27a、miRNA-27b和miRNA-19b-3p。乳腺癌中miRNA-128-3p、miRNA-27a、miRNA-27b及miRNA-19b-3p与RCOR3基因表达水平均呈负相关(P <0. 05)。泛癌症分析结果显示,结直肠腺癌、肺腺癌、肾透明细胞癌和子宫内膜癌中miRNA-128-3p与RCOR3基因表达均呈负相关(均P <0. 05),结直肠腺癌、膀胱尿路上皮癌、肺腺癌、肺鳞癌、肾透明细胞癌、子宫内膜癌和急性髓性白血病中miRNA-27a与RCOR3基因的表达均呈负相关(均P <0. 05)。结论乳腺癌中miRNA-128-3p和miRNA-27a、miRNA-27b及miRNA-19b-3p具有潜在的靶向抑制RCOR3表达的功能。