PCR-RFLP技术分析沼气池厌氧活性污泥细菌的多样性

摘要

应用PCR-RFLP和rRNA分析法研究了户用沼气池厌氧活性污泥细菌的多样性。采用直接提取法提取了户用沼气池微生物宏基因组DNA，构建了细菌的16S rDNA克隆文库。随机挑取了144个准确含有16S rDNA的阳性克隆进行PCR-RFLP分析，聚类得到46个OTUs（operational taxonomic units），其中3个OTUs是优势类群，分别占14％，10％和9％，21个OTUs只含有单个克隆。随机挑取了26个克隆进行测序，并构建了系统发育进化树。结果表明：农村户用沼气池中细菌种类较为丰富，占优势的类群分别为Firmicutes（28％）、Delta-proteobacteria（18％）和Bacteroidetes（17％），大多数16S rDNA序列与GenBank数据库中未培养细菌相似性最高（91％～99％），为进一步研究、利用沼气池能源提供了基础资料。