基于高通量测序分析紫贻贝冻藏过程中菌群组成变化

摘要

以蒸汽开壳后获得的新鲜紫贻贝肉(FS)、-18 °C冻藏1周紫贻贝肉(FS-1)、冻藏3周紫贻贝肉(FS-3)和冻藏9周紫贻贝肉(FS-9)为研究对象,采用DNA抽提试剂盒提取贝肉表面微生物基因进行高通量测序分析.各样本的有效序列区间为31 896～42 812条、操作分类单元(Operational taxonomic units,OTU)范围为289～681,其中OTU最少的是冻藏9周样品,最多的是新鲜紫贻贝肉.分析多样性指数可知,菌群丰富度最低的是冻藏3周紫贻贝肉.在属水平上,各样本优势菌群中均包含弧菌属(Vibrio).随冻藏时间的延长,葡萄球菌属(Staphylo-coccus)的占比逐渐降低.冻藏9周时新增希瓦菌属(Sh-ewanella)且相对丰度很大,另外仅新鲜紫贻贝和冻藏9周样本的优势菌群中含有不动杆菌属(Acinetobacter).