白斑狗鱼Dmrta1基因克隆及其表达分析

摘要

为初步研究果蝇Dsx基因和线虫Mab-3基因相关转录因子A1(Dmrta1)基因在白斑狗鱼性腺发育过程中的作用,采用RT-PCR方法克隆得到了白斑狗鱼Dmrta1基因,序列长度为1408 bp,共编码433个氨基酸,预测分子质量为36.047 ku,理论等电点为5.94.运用SMART、Swiss-model和MEGA软件对基因的结构及物种进化关系进行分析.氨基酸序列预测显示,该基因具有DM、DMA保守结构域,在进化关系上与虹鳟、红大麻哈鱼亲缘关系更近.据同源性分析发现,其氨基酸序列与银大麻哈鱼、红大麻哈鱼、虹鳟、大西洋鲑的同源性均超过75％.实时荧光定量PCR分析显示,Dmrta1基因在雌雄白斑狗鱼的性腺、鳃、肉等组织中均有表达,并且在精巢中的表达显著高于卵巢(P<0.05).在180日龄及320日龄中,该基因在精巢、鳃中表达量均较高.试验结果表明,在发育过程中Dmrta1基因在精巢中的表达量呈上升趋势,提示其在精巢发育成熟过程中具有重要作用.试验结果表明,该基因在鳃的形成和促进雄性性别的分化与功能的维持上可能具有重要作用,为白斑狗鱼的性别发育机制提供了基础资料.