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选择性剪接事件预测急性髓系白血病患者生存并揭示免疫微环境特征

         

摘要

目的深入剖析选择性剪接(AS)事件与急性髓系白血病(AML)患者预后、肿瘤微环境的关系,对AML的机制研究、临床诊断、预后评估和免疫治疗具有重要意义。方法Cox回归分析用于筛选AML患者预后显著相关的AS事件;最小收缩与选择算子(LASSO)回归分析过滤掉冗余AS事件防止模型的过度拟合来构建风险评分模型;受试者工作特征曲线(ROC)对模型预后预测效能进行评估;独立预后分析判断风险评分的独立预测能力;单样本基因集富集分析(ssGSEA)量化高低风险评分组的免疫微环境特征。结果18099个AS事件被确认为预后相关AS事件;AS模型中高风险评分患者预后更差;1年、3年、5年预后预测AUC值分别为0.822、0.852、0.838;独立预后分析表明风险评分可作为独立预后因子;高风险评分组免疫细胞浸润水平和免疫评分更低。结论AS预后模型能准确预测患者预后并评估免疫微环境特征,我们鉴定的几个核心分子,可能成为AML潜在的诊断和预后生物标志物,并为进一步的验证提供靶点。

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