基于TCGA数据库构建头颈部鳞癌RNA甲基化调控因子预后模型

摘要

目的探讨RNA甲基化调控因子与头颈部鳞癌(HNSCC)患者预后的相关性。方法从TCGA数据库获取HNSCC样本与正常样本的基因表达谱及临床数据,评估43个RNA甲基化调控因子预测预后的价值。使用LASSO回归分析构建预后模型,将患者按风险评分划为高、低风险组,并对模型进行评估。根据高、低风险组差异表达的基因进行GO富集分析和ssGSEA分析。结果HNSCC组织中显著差异表达的RNA甲基化调控因子共有38个。LASSO回归模型中,高风险组的5年生存率低于低风险组(P<0.001)。单因素与多因素COX回归分析结果显示该评分模型是HNSCC患者独立的预后因素(P<0.05)。GO富集分析和ssGSEA分析提示高风险组的免疫功能可能受到抑制。结论RNA甲基化调控因子在HNSCC的预后中发挥重要作用。