侵染白菜的黄瓜花叶病毒分离物基因组的全序列分析

摘要

对浙江省杭州地区白菜(Brassica campestris L.ssp.chinensis var.commuis Tsenet Lee.)上获得的CMV分离物(CMV-CTL)进行了全长克隆和基因组序列分析。结果显示:CMV-CTL的RNA1(Gen-Bank序列号:EF213023)全长为3357个核苷酸(nt),编码993个氨基酸(aa)的1a蛋白;RNA2(Gen-Bank序列号:EF213024)全长为3047nt,编码858aa的2a蛋白和111aa的2b蛋白;RNA3(GenBank序列号:EF213025)全长为2217nt,编码278aa的MP蛋白和218aa的CP蛋白。序列相似性分析表明,CMV-CTL与CMV亚组B中株系IA相似性最高,RNA1、RNA2和RNA3与该株系的相似性分别为91·3%、91·3%和93·6%。CP基因和RNA3的5′NTR核酸序列系统发生树分析表明,CMV-CTL与中国大多数CMV分离物一样,属于CMV亚组IB。