流感病毒H9N2亚型毒株RNA_4节段基因序列分析

摘要

目的　了解新分离到的禽H9N2亚型流感病毒毒株RNA4节段核苷酸间的关系。方法　病毒RNA经逆转录合成cDNA ,经聚合酶链反应 (PCR)扩增 ,产物纯化 ,采用双脱氧链末端终止法进行核苷酸序列测定。结果　香港鹌鹑流感病毒 (quHK197)、香港猪流感病毒 (swHK998)、香港鸡流感病毒 (ckHK997)和禽代表株威斯康星火鸡流感病毒(tywis6 6 )的H9N2亚型RNA4节段长度分别为 16 72、16 70、16 5 1和 16 83个核苷酸 ,编码血凝素 (HA)蛋白。这 3株分离到的禽H9N2亚型之间的同源性在 92 7%～ 96 9%之间 ,与禽H9N2代表株间的同源性在 87 8%～ 89 0 %之间。结论　新分离到的禽H9N2亚型毒株与代表株的同源性差异较大。