鱼腥草中抗血栓活性生物碱成分的虚拟筛选

摘要

抗血栓是预防和治疗心血管疾病的有效方法之一。基于传统中医理论、作者前期研究和相关文献,发现鱼腥草中生物碱类成分具有潜在的抗血栓活性,但是其药效物质基础和作用机制尚未明确。该研究采用分子对接技术虚拟筛选鱼腥草生物碱抗血栓的药效物质,搜集现已经从鱼腥草中报道的70个生物碱类化合物组成配体化合物库,选择P2Y1,P2Y12,凝血因子FⅪa,凝血因子FⅩa,PAR1,凝血酶等10个与血栓形成密切相关且具有已知晶体结构的靶蛋白作为受体数据库,以Drug Bank中对各靶蛋白有抑制作用并已上市或者即将上市的小分子药物为阳性对照化合物,设定各靶蛋白对应的已上市小分子药物最低打分(S)为阈值,应用Molecular Operating Environment软件(MOE,version 2016)的Dock功能进行分子对接,虚拟筛选出对接评分(S)低于阈值的化合物。对比分析了原配体、已上市药物和鱼腥草生物碱作用于各靶蛋白的主要活性位点,初步揭示了鱼腥草抗血栓活性的作用机制,为抗血栓类药物的研发提供了一定的参考。