重庆市医疗机构HIV-1感染者/AIDS病人HIV-1遗传分化和耐药突变研究

摘要

目的调查重庆市医疗机构中艾滋病病毒（HIV）1型（HIV-1）感染者/艾滋病（AIDS）病人中的HIV-1基因亚型、群体动力学及耐药性。方法收集2013年12月至2016年4月重庆多家医疗机构HIV-1感染者/AIDS病人血浆,通过提取核糖核酸（RNA）、反转录、巢式聚合酶链式反应（PCR）,系统发育学和群体遗传学的方法,扩增及分析HIV基因组pol区序列,并检测耐药相关突变。结果共收集657份HIV-1感染者/AIDS病人静脉血样本,扩增及测序得到256份有效的pol基因片段,HIV基因亚型分析显示,重庆医疗机构中流行的HIV-1毒株以CRF07BC（43.8%,112份）、CRF01AE（34.8%,89份）为主要基因型;随后依次为CRF08BC（8.2%,21份）、B（3.5%,9份）、CRF5501B（2.7%,7份）、CRF6801B（0.4%,1份）和CRF86BC（0.4%,1份）。检出耐药基因突变者94例（占36.7%）,无耐药基因突变者162例（占63.3%）。不同基因亚型间,pol基因蛋白酶区和反转录酶区的基因突变位点差异无统计学意义（P〉0.05）。对优势群体CRF07BC、CRF01AE和CRF08BC的群体遗传学分析,证实重庆市医疗机构中的HIV-1部分基因型群体正在经历扩张。结论重庆市医疗机构中HIV-1病毒基因突变和重组普遍存在。HIV-1CRF07BC、CRF01AE和CRF08BC基因亚型正在经历缓慢扩张的过程。需持续研究和监控重庆地区HIV-1在感染者中的遗传分化及耐药进展。