利用BSA-seq发掘棉花适宜机采的果枝长度相关QTL

摘要

[目的]将群体分离分析法与下一代测序技术相结合,定位与棉花果枝长度关联的数量性状位点.[方法]以Ⅰ式果枝品系苏机棉125和Ⅱ式果枝品种泗抗1号为亲本,构建棉花F2分离群体.根据F2群体单株中部果枝节间平均长度,选择极端性状单株分为2组,构建DNA混池.再对2个混池进行重测序,分析2个混池之间的单核苷酸多态性和插入缺失突变,并利用欧式距离法关联与果枝节间长度相关的数量性状位点.[结果]利用测序获得的单核苷酸多态性位点数据,在A3染色体上定位到1个与果枝节间长度关联的区域,区间范围为0.8 Mbp;利用测序获得的缺失突变位点数据,也在A3染色体上定位到1个关联区域,区间范围为1.09 Mbp;2个关联区域互相重合,重合区间为0.77 Mbp.[结论]本研究中Ⅰ式果枝相关基因被定位在A3染色体上,说明棉花Ⅰ式果枝和○式果枝的差异是因为遗传位点和模式的不同,而不是同一基因的剂量效应.