重病田和无病田棉花根组织中细菌群落结构的差异

摘要

为了研究黄萎病菌侵染条件下内生细菌群落结构多样性变化,以不同时期健康棉株和感染黄萎病菌(Verticillium dahliae)的棉株根部组织为材料,提取样品总DNA,扩增内生细菌16S rDNA的V3可变区,将扩增产物进行变性梯度凝胶电泳分析,并对21个优势条带进行切胶回收、克隆测序,构建系统发育树.结果表明:不同时期发病棉株和健康棉株样品可以聚成2大类,一是苗期和蕾期的根部样品,二是初花期和结铃期的根部样品;感染黄萎病棉株内生细菌种类多样性下降;BLAST比对结果发现21个克隆序列与GenBank数据库中已知16S rDNA基因序列同源性很高(99％～100％),绝大多数属于变形菌门(Proteobacteria),占总克隆序列的80.95％,其他不可培养细菌占19.05％.说明黄萎病菌的侵染能明显影响内生细菌群落结构多样性.