药物靶标超网络建模及实证分析

摘要

在描述药物靶标网络时,药物与靶标蛋白之间的交互关系往往是用复杂网络中的二部图来表征的,但这种方式在描述较复杂的高阶关系时有一定的局限性。由于超图中的边可以包含任意数量的节点,使得超网络能够准确地表达药物靶标之间多维、复杂的连接关系。基于超图理论及性质,综合药物靶标之间的交互关系构建两类超网络模型,并分别对其进行拓扑分析,进一步根据ATC分类(Anatomical Therapeutic Chemical,治疗学及化学分类法)对功能相似的药物进行局部聚类。通过对比分析发现,两类药物靶标超网络均具有明显的无标度特征,药物倾向于连接hub靶标蛋白,并且功能类似的药物具有相对较高的聚类系数。