基于多特征尺度的大肠杆菌启动子预测

摘要

本文对实验证实的741条大肠杆菌Sigma70启动子的序列进行预测研究.首先,基于RNA聚合酶与DNA的相互作用,利用位置打分函数对序列中的保守位点进行了衡量;然后,根据启动子的序列特征,利用离散性指标对序列中不同的碱基信息含量进行测量;最后,利用多元非线性判别分析实现了对大肠杆菌启动子的预测.10折叠交叉检验结果显示,总体预测精度达到85%以上.与其它算法比较结果显示,我们开发的这一算法能够更好地预测大肠杆菌启动子.