肝癌模型小鼠中线粒体源外泌体基因的差异性表达分析

摘要

cqvip:目的探讨线粒体源外泌体基因参与肝细胞癌(HCC)病理过程的可能分子机制。方法通过RNA-seq和生物信息学手段,分析HCC中差异表达的线粒体源外泌体基因(DEMEs)及其生物学功能。结果HCC组织中共鉴定出93个DEMEs,其中74个表达下调,19个表达上调。表达下调的DEMEs经功能富集,共富集到4个生物学过程(biological process,BP)、4个细胞组分(cellular component,CC)、2个分子活性(molecular function,MF)、1个信号通路(KEGG pathway,KG)和4个蛋白位点序列特征(UP_SEQ_FEATURE,US)。它们参与了氧化还原、脂质代谢等过程,且大量DEMEs还具有线粒体转运肽功能。而上调表达的DEMEs,除了富集到1个CC,即线粒体组分,还发现其中一些参与了跨膜转运、对过氧化氢和对机械刺激的反应过程,有些还具有转移酶活性和ATP结合能力,并参与癌症的发生和转移等病理过程。结论线粒体源外泌体基因在HCC肿瘤组织与非肿瘤组织存在差异性表达,生物信息学分析显示这种差异性表达的基因涉及多个生物学过程,提示它们可能通过多种途径影响HCC的发生。