应用PCR/RFLP对山东地区恙虫病东方体的基因型分析

摘要

目的鉴定山东地区恙虫病东方体的基因型.方法采用聚合酶链反应/限制性片段长度多态性分析(PCR/RFLP)技术对恙虫病东方体山东分离株、小盾纤恙螨匀浆及恙虫病病人全血中提取的DNA Sta56基因进行分析研究,并与Nested PCR基因分型的结果进行比较.结果山东地区35份标本(23株恙虫病东方体山东分离株、2份采自黑线姬鼠体外的小盾纤恙螨匀浆及10份恙虫病人全血)提取的DNA群引物扩增产物经HinfⅠ、HhaⅠ、SnaBⅠ酶切后呈现2种不同的RFLP图谱,经与已知序列的Ot内切酶图谱相比:33份Ot内切酶图谱与文献报告的日本地方株-Kawasaki株具有相似的酶切图谱,但缺乏HhaⅠ的酶切位点;另2份与Karp参考株具有相同的酶切图谱.该结果与Nested PCR基因分型的结果相一致.结论山东地区恙虫病东方体流行株主要基因型与日本地方株Kawasaki 型类似,但与日本地方株存在遗传差异;同时还有Karp型Ot存在.采用PCR/RFLP方法可以准确对Ot- Sta56基因分型.