中国特有小型猪内源性反转录病毒囊膜基因的克隆及进化分析

摘要

目的 克隆分析中国特有小型猪来源的猪内源性反转录病毒(PERV)囊膜基因(env),比较不同来源毒株的异同及系统进化关系.方法 应用RT-PCR的方法分别从中国实验小型猪、巴马香猪及五指山小型猪外周血淋巴细胞中扩增PERV env基因,克隆入T载体后测序;随后以PCR方法对克隆PERV env基因进行分型检测;最后采用DNAsis及DNAstar软件对克隆的env基因和国外毒株env基因进行同源性及系统进化进行分析比较.结果 本试验所克隆的3株PERV env基因长度分别为1983bp、1986bp及1968bp,分别编码661、662和656个氨基酸,分型检测均为PERV-A亚型.同源性分析表明:国内这3个分离株env基因与国外来源于不同宿主的PERV-A、B、C亚型env基因的同源性分别在92.8～96.5%、69.4～73.4%及77.5%～80.8%之间.结论 PERV中国株的进化与A、B、C亚型分类有关,与宿主、分布地域关系不大,且PERV-A亚型与C亚型的亲源关系更近于B亚型.