长春地区人与猪戊型肝炎病毒分子流行病学及部分基因序列分析

摘要

目的 分析长春地区猪和人群流行的戊型肝炎病毒的系统进化关系.方法 参照文献设计引物,对长春地区猪和人群流行的8株HEV(其中3株来源于人,5株来源于猪)进行RT-PCR,并将RT-PCR产物克隆到p MD18-T载体,筛选阳性重组质粒测序,测序结果采用Clustal X v.1.8进行多重比对分析,并与基因1～4型HEV代表株的核苷酸及氨基酸进行同源性比较,绘制遗传进化树.结果 本研究获得的8株HEV核苷酸同源性在91.2%～99.1%,推导氨基酸同源性在97.4%～100%之间;基因1～4型内各株序列间同源性分别为:87.9%～100%,100%,85.9%～96.6%,84.8%～100%.结论 研究表明获得的长春各株病毒均属基因4型,由进化关系看长春地区猪HEV与人HEV可能由同一毒株进化而来.