致泻性大肠杆菌和福氏2a志贺氏菌染色体上毒力岛和基因组岛插入相关的tRNA位点的研究

摘要

目的 探讨毒力岛及外源DNA片段的插入与异常tRNA位点的相关性.方法 采用PCR和杂交的方法,从异常tRNA位点寻找致泻性大肠杆菌和志贺氏菌的福氏2a菌基因组中可能的毒力岛或基因组岛.以Escherichia coli K12 MG1655序列中的86个tRNA位点的45个区域设计引物,对与K12亲缘较近的几类菌株的相关tRNA及其临近序列的完整性进行了初筛,对发现异常者进一步从其内部补充引物扩增证实,并联合杂交方法进行验证,以已知的E.coli O157∶H7 EDL933和S.flexneri 2a 301的序列来对比PCR结果.结果 菌株EDL933,S.flexneri 2a 301,EPEC 2348/69,ETEC 10407,EIEC 8401,E.coli O157∶H7 8823/64,EAEC O42,E.coli O25 F171中异常tRNA位点的个数分别是14,18,15,14,15,11,21,19.通过序列比对EDL933中8个tRNA位点有O岛插入,S.flexneri 2a 301中有6个插入了毒力岛,其余的位点均有外源片段插入或原有片段缺失.结论 毒力岛及外源DNA片段的插入与异常tRNA位点密切相关.