一起诺如病毒GⅡ.17型引起的急性胃肠炎病原学诊断及基因特征分析

摘要

目的 对长沙市2014年12月某厂区暴发的一起急性胃肠炎疫情进行病原学诊断及对其致病原进一步的基因分型研究.方法 共采集6例病人肛拭子标本和可疑水源标本4份,提取核酸后,诺如病毒GⅠ/GⅡ型real-time RT-PCR试剂盒检测;阳性标本普通RT-PCR扩增VP1基因片段,产物测序后BLAST比对确定其型别,并构建进化树分析其进化关系.结果 10份标本real-time RT-PCR扩增结果显示为诺如病毒GⅡ型,VP1区片段RT-PCR扩增后产物测序,BLAST比对发现与2014年香港诺如病毒株GⅡ/Hu/HKG/2014/GⅡ.17/CUHK-NS-463同源性最高,达99％,证实为诺如病毒GⅡ.17型;构建系统进化树分析显示本次疫情分离的毒株与日本、香港、台湾等亚洲地区的毒株亲缘关系更为接近,而与美国、法国等地区的毒株亲缘关系则较远.结论 诺如病毒是引起此次急性胃肠炎疫情的病原体,且引起暴发的病毒株属于GⅡ.17型.