正常和腹泻水貂肠道微生物16S rRNA测序差异性分析

摘要

为调查正常水貂和腹泻水貂肠道菌群差异及发病原因,本试验采集了正常和腹泻水貂的粪便进行16S rRNA测序,并展开微生物物种的分布和丰度聚类差异分析。结果显示,与正常水貂相比,腹泻水貂中厚壁菌门所占比例显著增多(P<0.05),变形菌门和丙型变形菌纲所占比例显著减少(P<0.05);梭菌纲、梭菌目、巴氏杆菌目、巴氏杆菌科、链球菌科、梭菌科、巴氏杆菌属、梭菌属、链球菌属、放线杆菌属所占比例均极显著增多(P<0.01),肠杆菌目、肠杆菌科、肠球菌科、沙雷氏菌属、肠球菌属所占比例均极显著减少(P<0.01)。由此可知,水貂肠道微生物中巴氏杆菌属、梭菌属、放线菌属、链球菌属等多种致病菌群占比及相对丰度显著增加是导致水貂腹泻的原因之一。本试验通过分析得出正常和腹泻水貂肠道内菌种的差异,对疾病的诊断和治疗有一定的意义,并对微生态制剂的发展提供了数据支持。