两株H3N2亚型猪流感病毒的遗传进化及分子特征分析

摘要

为对2012年广州规模化养猪场疑似流感病料中分离鉴定的2株猪流感病毒A/swine/Guangdong/1519/2012(H3 N2)(简称GD1519)和A/swine/Guangdong/1520/2012(H3 N2)(简称GD1520)进行遗传进化及分子特征分析,对两株病毒进行了全基因组的测序分析.通过对其8个基因片段的基因来源进行分析,构建系统进化树,遗传进化分析结果显示GD1519 HA、PB2、PA和NP基因片段均来源于近期人源H3 N2亚型Moscow/99-like亚分支;其NA和PB1基因片段来源于早期人源H3 N2亚型Victoria/75-like亚分支;其M和NS基因片段来源于近期人源H3 N2亚型New York/99-like亚分支.GD1520病毒的HA基因片段来源于近期人源H3 N2亚型Moscow/99-like亚分支;其NA和PB1基因来源于近期人源H3 N2亚型New York/99-like亚分支;其PB2、PA、NP、M和NS基因片段均来源于早期人源H3 N2亚型Victoria/75-like亚分支.分析结果暗示2株病毒可能均由不同时期的类人源H3 N2亚型流感病毒间基因重排而产生的新型H3 N2亚型猪流感病毒.本研究结果进一步证明猪可能是不同来源流感病毒的基因"混合器",开展猪流感病毒相关分子流行病学研究具有重要的公共卫生意义.