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木薯中lncRNA-CRR5在低温胁迫下的功能分析

         

摘要

低温胁迫严重影响木薯的生长、产量以及块根品质.长链非编码RNAs(lncRNAs)作为关键的调节因子,在植物响应非生物胁迫过程中发挥重要的功能.然而,lncRNAs在木薯中的功能和调控机制尚无报道.因此,为了研究木薯lncRNAs在低温胁迫应答中的功能,本研究以木薯主栽品种'60444' 为材料,利用低温处理前后的叶片转录组数据,鉴定到一个受低温胁迫调控的lncRNA(cold-responsive lncRNA5,CRR5).通过对其序列比对进行同源性分析,RNA二级结构预测和共表达分析鉴定来分析lncRNA-CRR5响应低温胁迫的分子功能.并根据基因的共表达分析推测CRR5的顺式作用和反式作用靶基因.这些结果为更进一步研究CRR5的功能提供了理论依据.

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