小鼠不同细胞间表观遗传修饰的变化对Pdx-1基因转录表达的影响

摘要

目的:通过比较小鼠不同细胞类型之间Pdx-1基因转录起始区的表观遗传修饰差异,探讨表观遗传修饰对Pdx-1基因转录表达的作用.方法:采用免疫共沉淀-实时定量PCR法检测小鼠胚胎干细胞(mES)、小鼠成纤维细胞株NIH3T3细胞和小鼠β细胞株 NIT-1细胞Pdx-1和MLH1基因转录起始区DNA甲基化和组蛋白修饰(H3K4m3、H3K9m3和 H3乙酰化)的状况.同时采用实时定量RT-PCR检测上述3种细胞各基因mRNA表达水平.分析基因的DNA甲基化水平、H3K4m3、H3K9m3和 H3乙酰化修饰与基因表达之间的相互关系.结果:(1)以mES细胞为对照,NIT-1细胞的Pdx-1基因转录起始区呈低DNA甲基化和高H3K4m3修饰(P<0.05),NIH 3T3细胞的Pdx-1基因的转录起始区的DNA甲基化、H3乙酰化、H3K4m3和H3K9m3修饰水平明显增高(P<0.05);(2)Pdx-1基因仅在NIT-1细胞表达,其表达与DNA甲基化存在等级负相关(r=-0.802,P<0.01),与H3K4m3修饰存在直线相关(r=0.997,P<0.01),与H3K9m3修饰存在等级负相关(r=-0.879,P<0.01);(3)管家基因MLH1的表达与所检测的表观遗传修饰无相关性.结论:DNA甲基化、H3K9m3与H3K4m3修饰能相互协调,共同调控Pdx-1基因的表达,对胚胎干细胞向β细胞分化具有重要意义.