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含内质控的新型检测HIV-1感染的双特异性探针实时荧光RT-PCR方法的建立

         

摘要

目的以包含内标 RNA 的病毒样颗粒作为内质控,建立一种新型的检测 HIV-1感染的包含双特异探针实时荧光 RT-PCR 方法(Dual-specificity probe real-time reverse transcriptase-PCR,DSPrtRT-PCR),提高HIV-1RNA 的检出率。方法采用针对 HIV-1基因组保守区域内两个不同区域的两条不同的荧光探针和两组引物,建立检测 HIV-1RNA 的实时荧光 RT-PCR 方法,并构建了内含HIV-1内标 RNA 的病毒样颗粒,将其作为本方法的内部假阴性质控,考察了所建立方法的检测灵敏度和特异性。比较了单探针和双探针检测方法在 HIV-1亚型检测能力、检测灵敏度和临床样本的检测适用性。结果所建立方法的灵敏度为125 U/ml;在检测 HIV-1阴性样本时具有100%的特异性。和单探针方法比较,双特异探针方法在HIV-1亚型检测中能检测到M族的所有亚型以及 O 族;检测灵敏度和单探针方法比较无统计学意义;在对60份临床样本的检测中,单探针方法只能检出39份,而双探针方法能检出50份(10份检测阴性的样本用 COBAS 检测证明为阴性)。结论本研究建立的 HIV-1 RNA 的 DSPrtRT-PCR 具有很高的检测灵敏度以及 HIV-1多亚型的检测能力。在对临床样本的检测中证明具有很好的临床适用性。

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