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人类基因组编码蛋白高通量芯片筛选原发性胆汁性肝硬化血清标志物

         

摘要

目的探讨用人类基因组编码蛋白高通量芯片(以下简称"高通量蛋白芯片")筛选出有诊断价值的PBC血清标志物的应用价值。方法用高通量蛋白芯片(包含17 718个人类基因编码蛋白,共有38 400个蛋白点)筛选21例PBC患者、20例疾病对照患者(AIH 7例,病毒性肝炎8例,其他自身免疫性疾病5例)和10名健康对照者血清,并用生物信息学软件提取筛选信息后,经统计软件分析确定有价值的诊断PBC的血清标志物。结果用抗GST抗体对高通量蛋白芯片进行检测的结果显示,该芯片蛋白点的检出率为97.6%,蛋白复点间检测信号强度的相关系数为0.98。用高通量蛋白芯片从PBC组、疾病对照组和健康对照组中筛选出4个差异有统计学意义的标志物(PDHA1、DBT、DLAT和HK1),他们在3组中的阳性率分别为66.67%(14/21)、5.00%(1/20)和0(0/10),57.14%(12/21)、5.00%(1/20)和0(0/10),52.38%(11/21)、0(0/20)和0(0/10),52.38%(11/21)、0(0/20)和0(0/10);3组4项指标分别比较的差异均有统计学意义(PDHA1:χ~2=16.79,P<0.01;Fisher精确检验,P=0.000;DBT:χ~2=12.86,P<0.01;Fisher精确检验,P=0.004;DLAT和HK1:Fisher精确检验,P均分别为0.01、0.05)。其中,针对PDHA1、DBT和DLAT蛋白的抗体为现已使用的PBC标志物——AMA-M2组成部分;针对HK1蛋白的抗体为新发现的PBC标志物,其对PBC的诊断敏感度为52.38%,特异度为100.00%。AMA-M2阳性与AMA-M2阴性PBC患者中未发现差异有统计学意义的血清标志物。经Fisher精确检验,ACA阳性与ACA阴性PBC患者间仅针对着丝粒B(CENPB)蛋白的抗体差异有统计学意义(Fisher精确检验,P=0.000)。结论高通量蛋白芯片是一种快速全面筛选诊断PBC标志物的技术。针对HK1蛋白的抗体对PBC具有较好的敏感度和特异度,可作为PBC新标志物。AMA-M2阳性与AMA-M2阴性PBC患者间未发现具有统计学意义的血清标志物,而针对CENPB蛋白的抗体可作为ACA阳性与ACA阴性PBC患者筛选的标志物。

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