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DNA微阵列芯片法检测慢性乙型肝炎拉米夫定和阿德福韦酯耐药突变

         

摘要

目的评价一种新研制的DNA微阵列芯片HBV基因型耐药检测试剂盒的临床应用性能。方法收集2008年12月至2010年6月224份CHB患者血清标本,提取HBV DNA,应用DNA微阵列芯片法和直接测序法平行检测HBV逆转录酶区(rt区)位点rtL180、rtA181、rtM204和rtN236的耐药突变。对结果不一致的标本进行克隆测序,以验证检测的准确性。结果芯片法和直接测序法均成功检测224份标本全部896个位点的耐药基因型,214份标本结果完全一致,其中82份检测到突变,132份为野生型HBV。2种方法检测HBV耐药突变结果的完全符合率为95.5%(214/224)。其余10份标本只用芯片法检测到突变:2份rtL180M突变、2份rtA181V突变、3份rtM204I突变、2份rtM204V突变、1份rtN236T突变,但是直接测序未检测到相应突变。包含突变序列的克隆所占比例为5.0%~15.0%。经克隆测序验证结果与芯片法完全一致。结论 DNA微阵列芯片法检测HBV耐药突变与直接测序法相比符合率高,并可检出低比例耐药突变毒株,有助于早期提示耐药的发生。

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