常见病原真菌鉴定基因芯片方法的建立

摘要

目的建立临床常见的病原真菌的基因芯片检测体系。方法选取8种临床常见真菌,包括白色假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、近平滑假丝酵母菌、土曲霉、黄曲霉、米根霉和烟曲霉。根据真菌ITS区设计引物和探针,进行扩增和芯片制备。通过将待检真菌的PCR产物变性后与点布探针的芯片杂交,观察并分析荧光信号强度,进行对真菌的快速检测。并选取临床真菌阳性标本和细菌阳性标本共25份进行验证。结果 25份临床阳性标本的芯片检测结果显示,10份细菌阳性的标本,经真菌基因芯片检测,全部为阴性,无荧光信号。其余15份真菌标本中,12份临床真菌阳性标本均鉴定出芯片中的某一种真菌的结果。另外采用克柔假丝酵母菌人为制备的3份待检样本,经检测,芯片中8种真菌位点无荧光信号,为阴性,仅有真菌通用探针得到荧光信号,表明该标本中有真菌存在,但无法确认是哪一种。结论本研究建立的基因芯片可对常见病原真菌进行快速准确的鉴定,为基因芯片应用于临床奠定了基础。