葡萄糖激酶基因6个标签单核苷酸多态性位点与2型糖尿病的相关性研究

摘要

目的探讨葡萄糖激酶（glucokinase,GCK）基因6个标签单核苷酸多态性（tag singlenucleotide polymorphisms,tagSNPs）位点rs2971672、rs12702070、rs2268569、rs2268573、rs2300587、rs1476891与2型糖尿病（type 2 diabetes,T2D）的关系。方法病例对照研究。选取2013年8月至2014年12月在中山大学附属中山医院住院的中国南方汉族T2D患者499例（T2D组）,同时选择在该院康体保健中心体检的汉族健康人499名作为对照组,对GCK基因的6个tagSNPs位点采用改良多重高温连接酶检测反应技术（improved multiple ligase detection reaction,iMLDR）进行基因分型,应用Hardy-Weinberg平衡规律检测样本代表性,采用χ~2检验、logistic回归分析比较T2D组和对照组基因型和等位基因频率的差异,并在加性、显性和隐性3种遗传模型下对各SNP位点进行相关性分析。应用Haploview软件构建GCK基因6个tagSNPs位点的单体型,分析是否存在连锁不平衡（linkage disequilibrium,LD）及不同的GCK单体型与T2D易感性的关系。结果 rs2268573、rs2300587、rs2268569、rs1476891的基因型（χ~2值分别为3.361、2.076、0.582、0.918,P均＞0.05）和等位基因频率（χ~2值分别为0.222、1.980、0.590、0.851,P均＞0.05）在T2D组和对照组之间差异均无统计学意义。rs2971672和rs12702070的基因型（χ~2值分别为6.896、7.990,P均＜0.01）和等位基因分布（χ~2值分别为4.708、5.979,P＜0.05、P＜0.01）在D2M组和对照组之间差异有统计学意义。在显性遗传模式下（rs2971672:OR=1.74,95%CI=1.17~2.57,P＜0.01;rs12702070:OR=1.54,95%CI=1.17~2.04,P＜0.01）以及在加性遗传模式下（rs2971672:OR=1.51,95%CI=1.06~2.14,P＜0.05;rs12702070:OR=1.26,95%CI=1.04~1.52,P＜0.05）2个SNP位点的基因型分布在D2M组和对照组之间差异有统计学意义。GCK基因6个位点中的5个位点有两个LD域,rs2971672和rs2300587共存在TC、TA、CA三种主要单体型,单体型TA和CA均降低个体患T2D的风险,OR值分别为0.81（95%CI:0.66~1.00,P＜0.05）和0.78（95%CI:0.62~0.98,P＜0.05）。rs2268569、rs12702070和rs1476891共存在TAG、TGG、TAT、CGG四种主要单体型,均与个体患T2D的风险无相关性（χ~2=2.718,P＞0.05）。结论在汉族人群中,GCK基因区域的rs2971672和rs12702070位点与糖尿病遗传易感性密切相关,而rs2268573、rs2300587、rs2268569、rs1476891位点与糖尿病遗传易感性无明确相关性。rs2971672和rs2300587LD域单体型TA和CA均降低个体患T2D的风险;rs2268569、rs12702070、rs1476891 LD域四种主要单体型均与个体患T2D的风险无相关性。