基于网络药理学和分子对接技术探讨祛湿化痰方治疗冠心病的作用机制

摘要

目的:应用网络药理学与分子对接技术探讨祛湿化痰方治疗冠心病潜在的分子及生物通路机制。方法:采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库检索药物有效成分及作用靶点;检索GeneCards和OMIM数据库获得冠心病相关基因;使用Venny软件绘制韦恩图;利用Cytoscape软件及STRING数据库构建平台网络;使用R语言,分析京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集以及基因本体(GO)生物过程;运用PubChem网站、PDB数据库寻找配体及受体结构,应用AutodockTools及Vina软件进行分子对接运算。结果:在祛湿化痰方核心药物中共筛选获得36个主要活性化合物、416个潜在作用靶点;7264个基因靶点与冠心病有关;祛湿化痰方与冠心病的交集蛋白靶点140个;核心基因蛋白靶点有7个,包括雌激素受体α(ESR1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、JUN、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、肿瘤蛋白p53(TP53)、蛋白激酶B1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶14;GO生物过程富集分析显示(MAPK14),祛湿化痰方治疗冠心病与氧化应激反应、对营养水平的响应等有关,KEGG通路富集分析获得170条相关的信号通路,与雌激素信号通路及磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)-蛋白激酶B(AKT)信号通路关联紧密;分子对接运算发现AKT1、ESR1与柚皮苷,MAPK14、MAPK3与汉黄芩素之间的结合能(≤-8.0 kJ/mol)较小,且具有稳定的分子构象。结论:祛湿化痰方中存在柚皮苷、汉黄芩素等多种小分子化合物,可以稳定结合ESR1、AKT1、MAPK1等多个基因受体,其作用的生物通路机制可能与雌激素信号通路及PI3K-AKT信号通路有关。