丙型肝炎病毒核心蛋白结合蛋白6猴同源基因N的克隆化与序列分析

摘要

目的:利用酵母双杂交技术,业已成功克隆了人类丙型肝炎病毒(HCV)核心蛋白结合蛋白6(HCBP6)的编码基因.为了阐明不同生物类型中HCBP6基因序列的同源性,阐明HCBP6的生物学功能,我们应用生物信息学技术,克隆猴HCBP6同源基因序列,并对其结构进行分析.方法:应用我们克隆的人HCBP6基因序列作为参照,对美国国立卫生研究院(NIH)国立医学图书馆(NLM)国立生物工程信息中心(NCBI)建立的核苷酸数据库以及在线分析软件进行分析.对已经克隆的不同生物来源的HCBP6的同源基因序列进行比较.结果:猴HCBP6的同源基因开放读码框架长度为570 bp,编码产物HCBP6蛋白由189aa组成.猴HCBP6的同源基因编码产物与人、猪、牛的HCBP6同源基因编码产物的同源性分别是96.27％、89.95％、85.71％.结论:生物信息学技术是克隆不同生物类型的同源基因序列的可靠、快捷途径.猴HCBP6同源基因的克隆化为研究不同种属来源的HCBP6基因的结构域功能、表达与调控等研究奠定了基础.