共生菌对小鼠肺泡巨噬细胞长链非编码RNA表达的调控作用

摘要

目的探讨共生菌群对小鼠肺泡巨噬细胞长链非编码RNA（long non-coding RNA, LncRNA）表达的调控作用。方法分离纯化共生菌缺失小鼠及正常小鼠肺泡巨噬细胞（alveolar macrophages, AMs）, 利用LncRNA芯片技术筛选差异表达的LncRNA并进行生物信息学分析, 利用荧光原位杂交（FISH）、RNA干扰等技术检测LncRNA-30162的亚细胞定位及其对RAW264.7细胞基因表达的调控。结果分选后的AMs纯度大于95%, 共生菌缺失小鼠与正常小鼠相比较, 其差异表达LncRNA共有634个（变化倍数≥2）, 上调363个（57.26%）、下调271个（42.74%）;差异LncRNA的靶基因与免疫系统调控、细胞分化、趋化作用等密切相关;干扰LncRNA-30162的表达可以降低RAW264.7细胞中CCL24及Arg1的表达水平, 干扰前CCL24及Arg1的表达水平分别为（420.23±56.25）μg/L、（2.63±0.31）×103U/L, 与干扰后表达水平（218.70±31.45）μg/L、（1.24±0.21）×103U/L比较差异有统计学意义（t=5.416、6.409, P=0.006、0.003）。结论共生菌可以调控小鼠AMs LncRNA的表达, 差异表达的LncRNA与多个基因功能分析分类和基因信号通路密切相关, LncRNA-30162可以调控RAW264.7细胞CCL24、Arg1的表达。