人乳头瘤病毒61、83和84型MY片段分析及核酸标准品制备

摘要

目的探讨山西省的HPV61、83和84型分离株MY片段中核苷酸及氨基酸的突变情况以及山西省分离株与α3中其他型别的同源性,制备三型别包含MY片段的标准品。方法使用HPV通用引物MY09/11对我国HPV61、83和84型分离株进行PCR扩增,并连接至pMD18-T载体,所得质粒进行序列分析,应用BioEdit生物学软件进行核苷酸水平和氨基酸水平的分析。结果HPV61和83型分离株分别与参考株序列U31793和AF151983比对,在核苷酸水平完全一致;HPV84型分离株与参考株序列AF293960比对,在核苷酸水平发生4个点突变,分别为C6760T、T6931C、T6951C和C6987A,其中C6987A导致D441E氨基酸残基的突变;MY-PCR反应对HPV61、84和83型标准品检测的灵敏度依次降低。结论我国HPV61和83型分离株与参考株序列相比较未发现突变,HPV84型与标准株相比存在着核酸和氨基酸水平的突变;MY09/11通用引物检测HPV61型标准品的灵敏度高于HPV83和84型。