烟台沿海地区人源和猪源戊型肝炎病毒基因型别的研究

摘要

目的 调查烟台市沿海地区人源与猪源戊型肝炎病毒（HEV）基因型别的相关性。方法 应用逆转录一巢式聚合酶联反应（RT—nPCR）方法对当地急性散发戊型肝炎患者、正常人群中抗HEV-IgM阳性者和当地养猪场的猪进行HEVRNA检测,并对HEVRNA阳性标本进行克隆测序和序列分析。结果 16例急性散发戊型肝炎患者中有7例粪便标本HEVRNA阳性;51份lgM阳性正常人群血清标本中有1份HEVRNA阳性;34份猪胆汁标本中有1份HEVRNA阳性。序列分析发现该地区HEV人株与猪株在ORF2部分区域的核苷酸序列同源性为87%～98.1%。7株患者的戊肝病毒基因型和1株猪的戊肝病毒基因型均为Ⅳ型,基因序列同源性在87%～98.1%之间;其中有6例患者和猪的基因序列同源性在93.9%～98.1%之间,为Ⅳ型a亚型;1例患者和猪的基因序列同源性为87%,为Ⅳ型d亚型。正常人群的1例戊肝病毒基因型为I型d亚型。该地区人与猪HEV的ORF2的部分基因片段与HEVⅠ～Ⅳ型的代表株进行比较,核苷酸序列同源性分别是82.5%～100%,81.7%～92.9%,81.4%～93.9%,84.9%～100%。结论 该地区人群中流行的HEV存在2个基因型3个亚型,主要以基因Ⅳa型为主,与猪群中流行的HEV基因Ⅳa型同源性较高;HEVI型在人群中散在存在。