浙江省2002-2006年禽流感H5N1病毒基因特性与进化重组分析

摘要

目的对近年来浙江省禽流感病毒H5N1分离株的基因特性与进化重组特征进行分析。方法通过对2002-2006年浙江省禽与人的HSN1病毒株进行全基因序列测定,采用Mega 3.0生物信息学软件分析病毒株基因特性并与相关基因型标准病毒株进行系统进化分析。结果2002- 2006年浙江省H5N1病毒株HA序列裂解位点序列含多个碱性氨基酸,符合高致病性禽流感病毒特征;与Gs/Guangdong/1/96相比,除Dk/Zhejiang/2/02和Ck/Zhejiang/8/03株外其他病毒株均在NA蛋白茎区缺失20个氨基酸。全基因系统进化分析表明,2002-2003年的分离株遗传基因基本属于当年流行的B、W、X、Y、Z等基因型,但部分病毒株不同基因片段属于不同基因型。结论浙江省禽类中也广泛存在H5N1的基因片段重组现象,2005年后的Ck/Zhejiang/24/05株及人HSN1 Zhejiang/16/ 06株各遗传基因基本上稳定于近年大陆流行的FJ-like基因型。