1株同时携带vanA、vanM的屎肠球菌高通量测序分析

摘要

目的了解耐万古霉素屎肠球菌EFM277的耐药基因分布特点及机制。方法用Illumina Hiseq平台对EFM277进行高通量测序,用生物信息学技术对数据进行拼接和分析。结果对耐万古霉素屎肠球菌测序数据进行分析,发现编码氨基糖苷类耐药基因包括aac(6′)-Ii、aph(3′)-Ⅲ、aac(6′)-aph(2″);四环素耐药基因tetM;大环内酯类耐药基因包括msrC、ermB;同时检出糖肽类耐药基因vanA、vanM,较为罕见。多位点序列分型(MLST)分析发现其可能是一种新的ST型,与ST17型最相近。毒力基因分析中发现其携带acm、esp、hyl 3种毒力基因。结论利用高通量测序技术阐明EFM277耐药机制,为临床用药提供更为有力的依据。