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人感染高致病性H5N6禽流感病毒的分子生物学特征

         

摘要

目的 分析2014-2015年3例新型人感染高致病性禽流感(HPAI) H5 N6毒株的血凝素(HA)与神经氨酸酶(NA)基因序列,探讨该病毒的遗传变异及分子生物学特征.方法 收集GenBank、全球共享禽流感数据倡议组织(GISAID)及浙江大学传染病诊治国家重点实验室提供的H5N6病毒基因序列,利用生物信息软件MEGA6.0及NetNglyc服务器对基因序列进行遗传进化和分子变异特征分析.结果 3例感染HPAI-H5N6患者毒株的HA与NA氨基酸序列的同源性分别为96.5% ~ 98.7%和90.1% ~98.2%;HA氨基酸序列比对分析发现A/Guangzhou/39715/2014(H5N6)和A/Sichuan/26221/2014(H5 N6)与A/duck/Eastern China/1111/2011(H5N2)同源性最近,分别为97.7%和98.5%;A/Yunnan/0127/2015(H5N6)与A/muscovyduck/Vietnam/LBM631/2014(H5N1)同源性最近(97.2%);NA氨基酸序列比对分析发现A/Guangzhou/39715/2014(H5N6)和A/Yunnan/0127/2015(H5 N6)与A/swine/Guangdong/K6/2010(H6N6)同源性最近,分别为97.2%和97.6%,A/Sichuan/26221/2014(H5N6)与A/duck/Guangdong/S3073/2010(H6N6)同源性最近(97.4%);进化树分析显示3例患者毒株处于2个不同的分支;HA基因包含有S137A、T160A等突变,糖基化分析显示有6~7个N-糖基化位点.结论 新型人感染HPAI-H5N6病毒是一种重组病毒,其HA基因来源于亚洲禽类H5亚型,NA基因来源于亚洲禽类H6N6;HA基因位点突变及N-糖基化改变可能有助于增强对人类的感染.

著录项

  • 来源
    《临床检验杂志》 |2016年第2期|156-159|共4页
  • 作者单位

    浙江大学医学院附属第一医院检验科;

    杭州310003;

    浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室;

    杭州310003;

    湖州市中心医院检验科;

    浙江湖州313000;

    浙江大学医学院附属第一医院检验科;

    杭州310003;

    浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室;

    杭州310003;

    浙江大学医学院附属第一医院检验科;

    杭州310003;

    浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室;

    杭州310003;

    浙江大学医学院附属第一医院检验科;

    杭州310003;

    浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室;

    杭州310003;

    浙江大学医学院附属第一医院检验科;

    杭州310003;

    浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室;

    杭州310003;

    浙江大学医学院附属第一医院检验科;

    杭州310003;

    浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室;

    杭州310003;

    浙江大学医学院附属第一医院检验科;

    杭州310003;

    浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室;

    杭州310003;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 流行性感冒;
  • 关键词

    禽流感H5N6病毒; 血凝素; 神经氨酸酶; N-糖基化;

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