新疆艾比湖嗜盐菌的细菌视紫红质和16S rRNA基因序列的研究

摘要

为了研究分析嗜盐古生菌物种与细菌视紫红质(BR)蛋白基因资源,从40份土壤、湖水及淤泥样品中分离出148株嗜盐菌,对其中6株菌采用聚合酶链式反应(PCR)方法对其编码螺旋C至螺旋G的蛋白基因片段和16S rRNA基因进行了扩增,并测定了基因的核苷酸序列.与已报道的相应片段进行对比,ABDH10,ABDH11和ABDH40中的螺旋C至螺旋G的蛋白与其他菌株差异显著.基于16S rRNA序列的同源性比较以及系统发育学研究表明,ABDH10和ABDH40是Natronorubrum属下的新成员和Natrinema属下的新成员,ABDH40的16S rRNA序列已登录到GenBank,其序列号为AY989910.ABDH11中的螺旋C至螺旋G的蛋白与其他菌株差异显著.