不同生理阶段边鸡卵巢转录谱的构建及卵泡发育相关基因的分析

摘要

本研究通过分析不同生理阶段边鸡卵巢转录表达谱,旨在找出与卵泡发育相关的基因并进行验证,以揭示边鸡就巢性强的遗传机制。构建代表不同生理期即70日龄(70 d,卵巢发育期)、165日龄(165 d,开产期)、220日龄(220 d,产蛋高峰期)和330日龄(330 d,就巢期)的边鸡卵巢基因表达谱,用转录组表达定量(RSEM)法对不同生理阶段边鸡卵巢基因表达进行相关性分析,通过基因差异表达、GO和KEGG分析筛选出与卵泡发育相关的候选基因,并应用实时定量PCR法对其表达进行验证。通过转录表达谱分析,共鉴定出18891个基因,已知基因有18063个,预测的新基因有828个;从转录表达谱中筛选出40个与卵泡发育相关的差异表达基因,其中,35个基因的表达量与发育卵泡数成正相关,FDX1L在70、220、165和330 d边鸡卵巢中表达量依次递减,NDRG4在70、165、220和330 d边鸡卵巢中表达量随日龄增加呈递减趋势,MC3R和PRLHR在70和330 d边鸡卵巢中表达量高于165和220 d的表达量;VIP仅在70、165和220 d边鸡卵巢中表达。随机取11个差异表达基因,经实时荧光定量PCR验证其相对表达量与转录表达谱一致;GO功能富集发现,差异表达基因主要集中在“生物过程”,其次是“细胞组分”,最后是“分子功能”;KEGG分析发现,差异基因主要集中在信号转导、免疫系统和信号分子与相互作用通路中。本研究通过分析不同生理阶段边鸡卵巢基因表达谱,挖掘与卵泡发育相关的基因,通过GO功能富集和KEGG分析,获得了差异表达基因的功能分类和信号通路,为揭示边鸡卵泡发育相关基因的分子调控及其就巢性提供依据。