猪妊娠期和分娩后肠道微生物多样性研究

摘要

本试验旨在研究母猪不同妊娠阶段肠道微生物区系的变化,分析肠道微生物与母体妊娠生理之间的关系,以期为维持正常妊娠提供参考。试验采用16S rRNA高通量测序技术,对长大二元健康母猪3个妊娠时期(妊娠30、70和110 d)和分娩后的肠道微生物组成进行研究。结果表明:随着妊娠日龄的增加,母猪肠道微生物多样性降低,且在妊娠30、70、110 d和分娩后肠道微生物的优势菌门均为厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)。在门水平上,随着妊娠的进行,螺旋体门(Spirochaetes)的相对丰度降低,变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)和Patescibacteria的相对丰度升高。在属水平上,随着妊娠的进行,普雷沃氏菌属(Prevotella)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)、梭杆菌属(Fusobacterium)、狭窄梭菌属1(Clostridium_sensu_stricto_1)、拟杆菌属(Bacteroides)、大肠埃希菌-志贺菌属(Escherichia-Shigella)的相对丰度升高,乳杆菌属(Lactobacillus)、密螺旋体属(Treponema)的相对丰度降低。其中,妊娠70和110 d时肠道菌群结构相似,且与妊娠30 d和分娩后肠道菌群结构差异较大,这可能与妊娠中后期母体代谢增强、体重增加、胎儿发育等相关。综上所述,母猪妊娠期肠道微生物是动态变化的,随着妊娠日龄的增加,肠道微生物多样性降低,丰富度升高,分娩后肠道微生物多样性和丰富度均降低;妊娠期和分娩后肠道中的优势菌门均为厚壁菌门和拟杆菌门,妊娠期的优势菌属为狭窄梭菌属1、乳杆菌属和拟杆菌属,分娩后的优势菌属为拟杆菌属、大肠埃希菌-志贺菌属和卟啉单胞菌属。