大约克猪肠道不同部位的菌群结构和短链脂肪酸含量研究

摘要

cqvip:本试验旨在研究大约克猪肠道不同部位的菌群结构和短链脂肪酸(SCFA)含量的异同。试验选取3头体重为(121.00±2.89)kg的180日龄大约克母猪,采集其十二指肠、空肠、回肠、盲肠和结肠内容物,提取微生物基因组DNA进行高通量测序分析其菌群结构,并测定SCFA含量。结果表明:从十二指肠至结肠中细菌总数、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)均在显著增加(P<0.05)。相对于十二指肠、空肠和回肠,盲肠和结肠的菌群物种组成更丰富,多样性及均匀程度更高(P<0.05)。在门水平上,厚壁菌门在各肠段菌群中均占绝对优势,相对丰度其次的门在十二指肠、空肠和回肠中为变形菌门(Proteobacteria),而在盲肠和结肠中为拟杆菌门;在属水平上,厚壁菌门的乳杆菌属、SMB53、梭菌属(Clostridium)以及变形菌门的弧菌属(Vibrio)为十二指肠、空肠和回肠中相对丰度较高的属;而厚壁菌门的乳杆菌属(Lactobacillus)、SMB53、链球菌属(Streptococcus)以及拟杆菌门的普氏菌属(Prevotella)是盲肠和结肠中相对丰度较高的属。相比于十二指肠、空肠和回肠,盲肠和结肠中的乳杆菌属、弧菌属、葡萄球菌属(Staphylococcus)和不动杆菌属(Acinetobacter)相对丰度显著降低(P<0.05),而瘤胃球菌属(Ruminococcus)、拟杆菌属(Bacteroides)、普氏菌属、粪球菌属(Coprococcus)、颤螺菌属(Oscillospira)、罗氏菌属(Roseburia)、毛螺菌属(Lachnospira)和粪杆菌属(Faecalibacterium)等SCFA产生菌的相对丰度显著升高(P<0.05)。beta多样性分析表明,十二指肠、空肠和回肠中的菌群结构相似性较高,盲肠和结肠两者之间菌群相似度较高,且与小肠段显著不同(P<0.05),同时盲肠和结肠内容物中的SCFA含量显著高于小肠段(P<0.05)。由此可见,大约克猪小肠和大肠中的菌群结构存在显著差异,小肠中以厚壁菌门和变形菌门为主,大肠中菌群以厚壁菌门和拟杆菌门为主。大肠段拟杆菌属、普氏菌属、魏斯氏菌属(Weissella)、罗氏菌属、密螺旋体属(Treponema)和瘤胃球菌属等典型SCFA产生菌的相对丰度较高,同时其SCFA含量也较高,二者呈显著正相关。