4株猪圆环病毒2型凉山州分离株全基因组进化分析

摘要

为了解猪圆环病毒2型(PCV2)凉山州分离株的基因型,本研究采用PCR方法对采自凉山州3个发病猪场的4个PCV2阳性样品进行全基因组序列的扩增、克隆、测序分析,并绘制遗传进化树.结果显示:4个PCV2凉山州分离株全基因组序列长度均为1767 bp,核苷酸同源性为99.4％～99.8％,与国内外101株PCV2参考毒株核苷酸同源性为93.8％～99.9％,与4个PCV2国产疫苗株核苷酸同源性为95.1％～96.0％;4个分离株ORF1和ORF2基因核苷酸同源性分别为99.3％～99.8％和99.6％～100％;构建的系统进化树显示,4个分离株均为PCV2d亚型,与YA1株(四川雅安,MH094769)的亲缘关系最近.本研究为凉山州PCV2疫苗毒株的选择提供了科学依据.