MALDI-TOF质谱技术对猪肠道菌群中携带mcr-1细菌的鉴定与聚类分型

摘要

为了解多粘菌素耐药基因mcr-1在猪肠道微生物群落中的分布特征,本研究采集分离同一猪肠道样品中的多粘菌素耐药菌,利用PCR进行mcr-1基因检测,采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对mcr-1阳性菌株进行种属鉴定与亲缘关系分析。结果显示,在收集获得的325株多粘菌素耐药菌中,136株(41.8%)含有mcr-1基因,包括大肠杆菌70株,肺炎克雷伯菌19株,放线杆菌47株。细菌蛋白指纹图谱进行聚类分析显示,70株mcr-1阳性大肠杆菌被划分为13个亚型,19株肺炎克雷伯菌被分为3个亚型,其中有17株菌属于同一亚型(占89.5%),47株放线杆菌均为同一克隆。上述结果表明mcr-1在肠道菌群中存在克隆传播现象,细菌指纹图谱的多样性也提示可能存在质粒或者其他转移元件介导的mcr-1水平传播。MALDI-TOF-MS作为一种新的技术,不仅能够实现细菌的快速鉴定,而且可基于细菌蛋白指纹图谱对菌株进行初步的亲缘关系分析。