填充型纳流液相色谱长柱的蛋白质组学分析性能考察

摘要

纳流液相色谱长柱用于蛋白质组学分析中,可以显著提高多肽的分离度和检出率,进而提高蛋白质的鉴定数目和可信度.本研究基于纳流液相色谱-电喷雾质谱联用平台,考察了柱床长度为1.5 m的超长纳流液相色谱柱,将其用于蛋白质组学分析中.与常规纳流色谱柱相比,使用长柱时,复杂多肽样品得到了优良的分离效果.蛋白质组学数据检索结果表明,使用1.5 m长柱进行前端的色谱分离,采用质谱识别肽段数提升了83.6％,肽段数目提升了74.4％,唯一肽段数目提升了75.0％,蛋白质鉴定数目提升了38.4％.研究结果表明,这类填充型纳流液相色谱长柱为高分辨蛋白质组学提供了一种新的分离工具.