木薯SYP基因的序列特征及表达分析

摘要

植物突触融合蛋白(SYP)是一类与植物细胞内囊泡介导转运有关的蛋白.部分SYP基因与植物对生物和非生物胁迫的响应有关.该文利用生物信息学工具分析了木薯(Manihot esculenta)SYP基因及其蛋白结构、核苷酸多态性和系统进化关系,并利用RT-PCR技术检测了木薯不同组织中SYP基因的表达.结果表明,木薯SYP基因及其蛋白结构均具有明显的规律性和家族成员间的保守性;SYP基因的cDNA在基因间以及不同品种间具高度一致性,核苷酸变异以同义替换为主.进化分析表明,植物SYP基因可分为2个亚家族,木薯SYP基因倾向于与蓖麻(Ricinus communis)SYP基因聚在进化树同一分支的末端.半定量RT-PCR分析表明,5个木薯SYP家族成员具有组织特异性.上述研究结果为木薯SYP基因功能研究和功能单核苷酸标记的开发奠定了重要基础.